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日志信息

    2024

  • 2024.09.27

    微课云 1.8.14 更新日志

    更新: 新增聚类气泡图模块

  • 2024.09.14

    微课云 1.8.13 更新日志

    更新: 新增GWAS-CMplot可视化套件模块

  • 2024.08.23

    微课云 1.8.12 更新日志

    更新: 云平台分组更新

    更新: funguild预测加入多样性分析组合工具包

    优化: 修复ggcor不能正常运行bug,修复进化树下载图片bug

    优化: CCA/RDA增加设置字体格式

    优化: 修复气泡图图例在字体加粗情况显示不完全bug

    优化: 修复线性回归图点和方程式字体大小不能设置为0的bug

    优化: 修复主成分分析PCA字体变化没有全图应用的bug

    优化: 线性回归图增加水印显示设置、方程式位置设置、方程式系数有效数字位数设置

    优化: PLS-DA增加显示背景参考线

    优化: qPCR相对定量基因丰度计算和绘图增加坐标轴字体颜色设置

    优化: Circos物种关系图示例文件更改,改为正常otu文件格式

  • 2024.08.16

    微课云 1.8.11 更新日志

    更新: 新增模块进化树

    优化: lefse分析2.0模块进化分支图新增设置图片长宽

  • 2024.08.09

    微课云 1.8.10 更新日志

    优化: 热图更新环形热图

    优化: 热图、堆叠柱状图新增字体和字体样式

    优化: FUNGuild功能预测增加设置显示功能分类数量

    优化: 解决pipe多样性流程中pca、pcoa、top丰度的冲击组成图结果图无法显示的bug

    优化: 三维pca内部线改成虚线

    优化: 解决pcoa图上坐标显示为(PCOA1/PCOA2),和报告中图坐标轴(PC1/PC2)不一致

  • 2024.07.30

    微课云 1.8.9 更新日志

    优化: 峰峦图更改为密度峰峦图,分组文件修改;

    优化: edger增加显示差异显著前几名基因名称功能;

    优化: 气泡图增加分组,新增字体参数设置,增加丰度排序和设置显示TOP物种功能;

    优化: 权重网络图增加基因节点颜色和大小随节点度大小而改变的功能;

    优化: 树状图增加字体样式选择;

    优化: 修复误差折线图非必需项也需满足输入条件的bug;

  • 2024.07.12

    微课云 1.8.8 更新日志

    优化: 误差折线图增加折线虚实线、增加断轴、纵轴值数量;

    优化: 带箭头的PCA图增加箭头颜色选择,CCA/RDA增加置信区间,断轴柱状图增加柱子数值显示,增加纵轴数值设置;

    优化: 采样点分布图新增省会坐标显示、样本文字显示、省会指向箭头显示;

    优化: 冲击组成图,新增字体参数斜体显示;

    优化: 解决热图自动聚类特殊字符不支持的问题;

  • 2024.07.01

    微课云 1.8.7 更新日志

    更新: 增加动态网络图、序列截取工具、ANOSIM、FUNGuild、图片色系提取、stamp差异分析、在线prokka注释工具使用说明;

    优化: 解决富集气泡图气泡大小参数无法更改的问题;

  • 2023.12.28

    微课云 1.8.6 更新日志

    更新: 菜单栏增加云流程,点击可跳转到交付系统。

  • 2023.09.25

    微课云 1.8.5 更新日志

    更新: 采样点分布图增加世界地图;

  • 2023.08.14

    微课云 1.8.4 更新日志

    更新: 新增工具细菌/真菌学名查询工具;

    优化: 提高稀释曲线运行效率;

  • 2023.07.04

    微课云 1.8.3 更新日志

    1、更新: 新增工具带箭头的PCA图;

  • 2023.04.27

    微课云 1.8.2 更新日志

    1、优化:lefse分析2.0删除参数最大分类学级别数,完善结果图上的分类名;

    2、优化:气泡图改名为富集气泡图,常规气泡图改名为气泡图;

  • 2023.04.19

    微课云 1.8.1 更新日志

    1、优化:管理员获取任务文件页面表格增加两列:结束时间和任务耗时;

    2、优化:top丰度的冲击组成图增加选填参数:others合并比例;

    3、优化:PCA、PCoA结果图图例顺序调整为与分组文件顺序一致;

  • 2023.04.11

    微课云 1.8.0 更新日志

    1、更新:更新箱线图、热图、CCA(RDA)的常见FAQ;

    2、优化:qPCR相对定量基因丰度计算和绘图修改输入文件格式;

    3、优化:解决任务编号冲突问题;

    4、优化:解决相关性组合图文件列名太长会导致运行失败的问题;

    5、优化:优化在线prokka注释输入文件校验规则;

  • 2023.04.10

    微课云 1.7.9 更新日志

    1、更新:新增工具qPCR相对定量基因丰度计算和绘图;

    2、更新:新增工具在线prokka注释;

  • 2023.03.24

    微课云 1.7.8 更新日志

    1、更新:top丰度的冲击组成图、ANOSIM分析、upset图、带聚类树的堆叠柱状图、常规气泡图、stamp差异分析加入多样性分析组合工具包;

    2、优化:搜索功能回车填充输入框的效果取消;

    3、优化:多样性分析组合工具包工具分类调整。

  • 2023.03.20

    微课云 1.7.7 更新日志

    1、更新:新增stamp分析;

    2、更新:新增图片色系提取;

    3、优化:处理误差折线图和线性回归图颜色一行显示的问题;

    4、优化:表格转置输出文件表头去掉;

    5、优化:解决lefse分析2.0不能重绘的问题。

  • 2023.02.16

    微课云 1.7.6 更新日志

    1、更新:新增FUNGuild功能预测;

    2、更新:新增微课GPT。

  • 2023.02.03

    微课云 1.7.5 更新日志

    1、更新:更新转录组使用说明;

    2、更新:三维PCA增加“是否归一化”参数设置;

    3、优化:处理了lefse分析差异特征图介绍文字显示不全、top丰度的冲击组成图结果图颜色不对应、三元图下载文件说明错误、峰峦图标签错误、峰峦图结果文件不显示等问题。

    4、优化:所有工具列表中ggcor相关性组合图改名为相关性组合图;

    5、优化:PCA“是否归一化”参数默认修改为不进行归一化;

  • 2022

  • 2022.11.01

    微课云 1.7.4 更新日志

    1、更新:新增Anosim分析;

  • 2022.09.13

    微课云 1.7.3 更新日志

    1、更新:常规气泡图加入转录组分析组合工具包;

    2、优化:软件中心的菜单进行了调整;

    3、优化:解决转录组分析组合工具包和多样性分析组合工具包历史记录加载缓慢的问题;

    4、优化:解决多样性分析组合工具包Circos物种关系图运行成功不能正常跳转的问题。

  • 2022.08.19

    微课云 1.7.2 更新日志

    1、更新:更新ggplot2进阶物种组成图、ggtreeExtra进化树加热图、菌种鉴定分析、常规气泡图的使用说明;

    2、优化:转录组组合工具包和多样性分析组合工具包的菜单栏优化;GO富集分析位置调整方式修改为并排;在未登录状态点击需登录才能访问的资源时,页面跳转到主页;edgeR差异分析的组间比较文件增加表头:第一列为treatment,第二列为control,不区分大小写。

  • 2022.08.12

    微课云 1.7.0 更新日志

    1、更新:新增转录组分析组合工具包;

    2、优化:edgeR差异分析工具实现可以分析多组数据;常规气泡图删除修改气泡大小的功能;修复常规气泡图不能下载结果集的问题。

  • 2022.07.29

    微课云 1.6.9 更新日志

    1、更新:新增工具常规气泡图;

  • 2022.05.20

    微课云 1.6.8 更新日志

    1、更新:更新NMDS、Tcseq基因表达趋势分析、PLS-DA、肠型分析图、相关性组合图、绘制带组内差异比较的柱形图或箱线图、VPA分析(CCA-RDA)、堆积面积图、upset图、方差分解分析(VPA)、带聚类树的堆叠柱状图、桑基图、采样点分布图、表格转置、两表格合并、多表格合并的使用说明;

    2、优化:优化多样性指数盒型图与箱线图,去掉T检验参数,默认执行wilcoxon秩和检验;

  • 2022.05.20

    微课云 1.6.7 更新日志

    1、优化:解决稀释曲线上传文件只有一个样本运行报错的bug;

    2、优化:top10丰度的冲击组成图增加top数量展示和是否合并低丰度两个参数;

  • 2022.05.20

    微课云 1.6.6 更新日志

    1、更新:新增模块采样点分布图;

  • 2022.05.20

    微课云 1.6.5 更新日志

    1、更新:气泡图示例文件更改;

    2、更新:新增模块top丰度的冲击组成图;

    3、优化:多样性指数盒型图、箱线图(Boxplot)增加判断是否做T检验;

    4、优化:方差分解分析VPA的上传文件otu第一列可以是非数字;

  • 2022.05.20

    微课云 1.6.4 更新日志

    1、更新:新增基础气泡图、带聚类树的堆叠柱状图;

    2、更新:断轴柱状图工具增加修改字体功能;

  • 2022.05.13

    微课云 1.6.3 更新日志

    1、更新:柱状图改名为:堆叠柱状图 ;

    2、更新:ANOVA方差分析、circos物种关系图、肠型分析图、OTU抽平、稀释曲线使用说明更新;

    3、更新:upset图上传文件形式更新;

    4、更新:云平台大部分工具增加修改字体功能;

    5、优化:稀释曲线删除曲线弯折点参数;

    6、优化:VPA方差分析上传文件检测增加环境因子总数比样本总数少两个及以上的条件;

    7、优化:火山图和edgeR模块图中添加对上调下调的个数统计;

    8、优化:去掉相关性组合图中字体参数多余的标题修改设置;

  • 2022.04.29

    微课云 1.6.2 更新日志

    1、更新:新增堆积面积图、upset图;

    2、更新:T检验、柱状图、Wilcoxon秩和检验、Kruskal-Wallis秩和检验使用说明更新;

    3、优化:优化热搜词逻辑,没有搜索到软件的热搜词不再添加到热搜词库中;

    4、优化:优化任务界面查询任务方式,解决查询慢的问题;

    5、优化:优化当样本过多时,小提琴图由于颜色不够导致的报错;

    6、优化:修改稀释曲线的上传文件,不再需要分类列;

    7、优化:优化otu抽平模块结果表头与输入文件表头不一致的情况;

  • 2022.04.22

    微课云 1.6.1 更新日志

    1、更新:新增OTU抽平模块与稀释曲线模块;

    2、更新:花瓣图、tSNE模块、多样性分析组合工具包使用说明更新;

    3、更新:柱状图工具增加取均值按钮,可以将同一组多个生物学重复合并后绘制柱状图;

    4、更新:在搜索框后添加热搜词汇和最近常搜词汇,点击可添加到搜索框进行搜索;

    5、更新:所有软件页面的搜索框添加模糊匹配功能;

    6、优化:将上传文件中多出的空格或制表符的bug;

    7、优化:添加管理员面板身份验证;

    8、优化:多样性分析组合工具包设置主成分分析(PCA)和三维PCA处理数据方式为默认不归一;

    9、优化:多样性分析组合工具包在任务完成后刷新重绘页面显示不了重绘参数和图片以及切换不了结果软件的bug;

    10、优化:多样性指数盒形图绘图按输入文件分组排序;

    11、优化:修复绘制带组内差异比较的柱形图或箱线图在选择分组方式为大组为文件第三列,小组为文件第二列时,在重绘时可能报错的bug;

    12、优化:优化重绘界面不能下载中文名上传文件的bug;

    13、优化:优化肠型分析图在样本过多时,颜色参数无法显示的bug;优化肠型分析图中最佳聚类数的显示问题;

    14、优化:优化组内相关性分析、组间相关性分析修改部分基因节点形状和颜色功能;

  • 2022.04.14

    微课云 1.6.0 更新日志

    1、更新:metacoder模块上传分组文件为两组时,默认绘制叠图;

    2、更新:新增肠型分析图模块;

    3、更新:每个重绘界面都增加写作建议提醒,并写入到结果软件包中的reference.txt文件中;

    4、更新:箱线图和多样性指数盒形图模块增加显著性差异检验标识,并在外圈加框线,解决修改说明标题时,会出现两个图例的bug;

    5、更新:更新三元图、树图、随机森林分析、edgeR差异分析、配对数据差异比较、NMDS、ggcor相关性组合图、桑基图、哑铃图、VPA分析、菌种鉴定分析和带组内差异比较柱状图模块的视频教程;

    6、优化:多样性分析组合工具包默认展示pipelineSoft.txt文件中按顺序第一个成功的软件重绘界面;

    7、优化:优化当多样性分析组合工具包上传的丰度文件存在unclassified时,Metacoder Tree不成功的问题;

    8、优化:.解决柱状图分组顺序问题;

    9、优化:优化技术支持图点击展示相同图片的bug;

    10、优化:解决plsda,pca,pcoa,nmds,tsne说明标题不能修改bug;

  • 2022.04.02

    微课云 1.5.9 更新日志

    1、更新:多样性分析组合工具包添加组间相关性模块,并更新层级显示为汉字;

    2、更新:随机森林分析模块文件检测优化---样本数不能少于10个,分组文件分组不能少于2组,每组重复不少于5个,更新示例文件;

    3、优化:优化在文件检测时,由于缺少表头导致的文件检测时间过长的bug;

    4、优化:ggplot2配对差异检验模块增加对文件前两列表头的检测,前两列表头必须为Group、Paired(不区分大小写);

    5、优化:将GO富集分析和KEGG富集分析上传背景基因文件的文件大小限制调整为20M,并取消GO富集分析中的pvalue小于等于0.05的限制;

    6、优化:pca、PCoA、NMDS和pls_da的2D图中,增加绘制置信椭圆时是否填充椭圆的参数;

    7、优化:调整上传文件逻辑,优化在重新上传同一命名文件(或上传同一文件)时,之前不能点击提交的bug;

    8、优化:优化多样性分析组合工具包重绘界面的切换工具栏显示;

    9、优化:优化花瓣图图例大小调整到0时出现绘图错误的bug,更新为图例大小调整为0时,不显示图例,并取消中心圆大小调整参数;

  • 2022.03.25

    微课云 1.5.8 更新日志

    1、更新:新增花瓣图模块;

    2、更新:tSNE、三维PCA模块重绘添加形状分组设置,可设置分组形状;

    3、优化:取消重绘时三维pca和plsda3d图的x、y、z轴的默认范围;

    4、优化:分析流程16s扩增子pipeline工具更名为设置多样性分析组合工具包,新增花瓣图模块;

    5、优化:多样性分析组合工具包添加设置otu层级参数,可以定义设置多样性分析组合工具包中的热图、柱状图、随机森林、CCA/RDA的画图otu层级,默认为2(门水平);

    6、优化:取消多样性分析组合工具包上传otu文件超过200条的限制;

    7、优化:更新火山图(Volcano)的使用说明;

  • 2022.03.22

    微课云 1.5.7 更新日志

    1、更新:分析流程16s扩增子pipeline工具添加新模块(lefse分析2.0,Metacoder 分类学树绘制,FAPROTAX功能预测,组内相关性分析,CCA/RDA);

    2、更新:分析流程16s扩增子pipeline工具新增文件检测---当选择上传环境因子文件后,即加入CCA/RDA分析时,otu丰度表的otu数据不允许超过200条;

    3、更新:pls-da的2D和3D图、NMDS、PCoA模块新增形状分组,可更改分组的形状;

    4、优化:优化CCA/RDA模块中,上传otu文件的逻辑,不允许上传超过200条otu;

    5、优化:修改CCA/RDA模块中,envfit_result.xls文件的描述为相关系数平方及P-values;

    6、优化:优化柱状图偶尔出现的自定义x轴样本顺序失效的bug;

    7、优化:设置维恩图上传文件方式一固定格式为---使用制表符作为分隔符、使用第一行作为表头;

  • 2022.03.14

    微课云 1.5.6 更新日志

    1、更新:新增分析流程16s扩增子pipeline工具(部分上线,热图(Heatmap),Circos物种关系图,柱状图,多样性指数盒型图,ggplot2-配对数据差异比较,主成分分析(PCA),三维PCA,PCoA,NMDS,tSNE,PLS-DA,方差分析(ANOVA),Wilcoxon秩和检验,随机森林分析);

    2、优化:Kruskal-Wallis秩和检验模块对于物种全是0的数据进行删除;

    3、优化:柱状图物种比例计算由之前的占所有样本的占比改为占当前样本的占比,并调整柱状图图例排列顺序;

    4、优化:使用说明更新,主成分分析(PCA),CCA/RDA ,热图(Heatmap),箱线图(Boxplot),权重网络图 ,维恩图(Jvenn图),柱状图,组内相关性分析,FAPROTAX功能预测,PCoA 三元图,组间相关性分析,lefse分析2.0,edgeR差异分析;

  • 2022.02.23

    微课云 1.5.5 更新日志

    1、更新:暂时下线tax4fun功能预测模块;

    2、优化:修复组间相关性网络图调图参数显示错乱问题;

    3、优化:edger差异分析模块更换示例文件,参数P值阈值改为FDR阈值,默认值0.05,F值阈值改为FC阈值,默认值1。并且在分组文件中,首先出现的分组为处理组,后出现的为对照组;

    4、优化:火山图模块参数P值阈值改为FDR阈值,默认值0.05,F值阈值改为FC阈值,默认值1;

  • 2022.01.27

    微课云 1.5.4 更新日志

    1、更新:动态网络图模块整体优化更新;

    2、优化:维恩图新增以上传文件的方式绘图后,可下载csv文件的功能;

  • 2022.01.14

    微课云 1.5.3 更新日志

    1、更新:线性回归图模块增加R值和p值的显示,并可调整小数位数;

    2、优化:修复circos圈图外圈的刻度画不满整个染色体的bug;

    3、优化:修复三元图任务详情界面上传文件展示问题;

    4、优化:优化菌种鉴定分析的文件检测逻辑,现在可以上传同一条序列带有换行的序列文件;

  • 2021

  • 2021.12.29

    微课云 1.5.2 更新日志

    1、更新:新增每个模块在任务详情界面点击使用软件名即可跳转到该软件的功能;

    2、更新:新增在任务详情界面可以查看并下载任务上传的文件的功能(此次更新之前上传的文件无法查看和下载);

    3、优化:修复热图模块不能修改颜色的bug;

    4、优化:GO富集分析模块异常运行失败的bug;

    5、优化:修复lefse分析2.0模块,在上传.biom格式文件时,不能运行的bug;

    6、优化:修复Emboss Abiview模块运行任务失败的bug;

  • 2021.12.17

    微课云 1.5.1 更新日志

    1、更新:新增方差分解分析 (VPA)模块;

    2、优化:组间相关性、组内相关性模块的热图部分以及热图(Heatmap)模块添加热图尺寸比例调整参数;

    3、优化:菌种鉴定分析模块增加对非蛋白输入文件的检测与提示;

    4、优化:lefse分析2.0模块示例文件调整;

  • 2021.12.10

    微课云 1.5.0 更新日志

    1、更新:主成分分析(PCA)模块增加形状分组,可同时设置数据点的形状和颜色;

    2、优化:修复CCA/RDA模块调整文件样本顺序后会导致结果不一致的bug;

    3、优化:CCA/RDA模块增加相关系数平方(r2)及P-values结果文件表格;

    4、更新:增加哑铃图和ROC曲线模块的使用说明;

  • 2021.12.02

    微课云 1.4.9 更新日志

    1、更新:ggraph绘制网络图更新为动态网络图;

    2、优化:修复权重网络图重绘参数布局错乱的bug;

    3、优化:菌种鉴定分析模块的结果图、BLAST比对结果表以及newick文件中增加物种名显示;

  • 2021.11.19

    微课云 1.4.8 更新日志

    1、优化:修复VPA分析(RDA/CCA)下载不了图片的bug;

    2、优化:修复热图列名或行名存在空格时导致的运行失败的bug;

    3、优化:组间相关性模块输入文件增加排序规则,修复两个输入文件第一列顺序不一致时得出错误结果的bug;

    4、优化:修复Circos圈图重绘时基因组窗口不显示的bug,修复重绘页面布局参数显示错乱的bug;

  • 2021.11.12

    微课云 1.4.7 更新日志

    1、更新:ROC曲线图;

    2、优化:修复lefse分析2.0运行失败的bug;

    3、优化:更新lefse分析2.0的使用说明;

  • 2021.11.05

    微课云 1.4.6 更新日志

    1、更新:绘制带组内差异比较的柱形图或箱线图;

    2、优化:修复柱状图不能调整组间样本顺序的bug,并优化提示样本排序输入的格式;

    3、优化:修复NMDS由于NA值导致不能运行的bug;

    4、优化:修复NMDS模块运行缓慢的bug;

    5、优化:lefse分析2.0增加txt文件的检测;

    6、优化:优化lefse分析2.0模块中进化分支图的图例显示方式;

  • 2021.10.29

    微课云 1.4.5 更新日志

    1、更新:ggraph绘制网络图整体更新;

    2、更新:所有模块除之前限制上传的文件大小为5M的不变外,其他上传的文件限制文件大小为10M;

    3、优化:修复Emboss Abiview模块不能正常运行的bug;

    4、优化:修复维恩图文件列名含特殊字符时,不能下载结果图片的bug;

    5、优化:修复三维PCA运行后不展示结果的bug;

  • 2021.10.22

    微课云 1.4.4 更新日志

    1、新增:菌种鉴定分析;

    2、更新:暂时下线PICRUST2功能预测模块;

    3、更新:给NMDS模块结果图新增stress值显示;

    4、优化:修复柱状图重绘时,当OTU名不为数字时,重绘失败的bug;

  • 2021.10.15

    微课云 1.4.3 更新日志

    1、更新:方差分析(ANOVA)、Kruskal-Wallis秩和检验、Wilcoxon秩和检验、树状图、Tax4Fun功能预测、火山图(Volcano)、PICRUST2功能预测、小提琴图、三元图、多样性指数盒型图更新使用说明;

    2、更新:Wilcoxon秩和检验、Kruskal-Wallis秩和检验、T检验、方差分析(ANOVA)、circos物种关系图、Metacoder Tree、配对数据差异比较模块的教学视频更新;

    3、优化:修复三元图不能正常运行的bug;

  • 2021.09.29

    微课云 1.4.2 更新日志

    1、新增:峰峦图;

    2、更新:ggplot2-配对数据差异比较 、随机森林、Metacoder Tree、tSNE、edgeR差异分析、曼哈顿图(Manhattan)、高级散点图、多元线性回归分析、线性回归图、T检验、三维PCA、Circos物种关系图更新使用说明;

    3、优化:修复PICRUST2功能预测模块运行报错后不停止运行的bug;

    4、优化:柱状图模块新增重绘参数,可调整Y轴丰度排序方式(从下至上);

  • 2021.09.22

    微课云 1.4.1 更新日志

    1、新增:VPA分析(RDA/CCA);

    2、优化:优化对火山图(Volcano)模块的上传文件的格式检查;

    3、优化:修复PICRUST2功能预测模块因为系统文件格式而导致运行失败的bug;

  • 2021.09.10

    微课云 1.4.0 更新日志

    1、新增:箱线图(包括箱线图(Boxplot)和多样性指数盒型图模块)新增颜色填充参数选项,默认填充;

    2、优化:修复PICRUST2功能预测模块因为系统文件格式而导致运行失败的bug;

    3、优化:修复edgeR差异分析模块修改P阈值和F阈值无效的bug;

    4、优化:ggplot2-配对数据差异比较模块示例文件减少sechao1和seACE列;

    5、优化:修复Circos物种关系图模块任务运行意外失败的bug;

  • 2021.09.07

    微课云 1.3.9 更新日志

    1、新增:ggtreeExtra给进化树加热图;

    2、新增:edgeR差异分析模块新增P值阈值和F值阈值两个参数;

    3、优化:edgeR差异分析模块P值默认值修改为0.05;

    4、优化:edgeR差异分析模块更新底层运行脚本,以及edgeR运行环境的更新;

    5、优化:Qiime格式分类学信息输入文件Taxon Table兼容性优化,修复文件不能上传的问题;

  • 2021.08.27

    微课云 1.3.8 更新日志

    1、新增:ggplot2绘制经典哑铃图;

    2、优化:优化logo展示;

    3、优化:Qiime格式分类学信息输入文件Taxon Table兼容性优化,修复文件不能上传的问题;

    4、优化:PICRUST2功能预测模块结果文件添加*_metagenome_unstrat_descrip.tsv文件,该文件在原*_metagenome_unstrat.tsv文件基础上添加descriptions描述列;

  • 2021.08.20

    微课云 1.3.7 更新日志

    1、新增:ggsankey绘制桑基图;

    2、优化:增加对ggcor相关性组合图由于所选分组有多行数据为0报错的提示;

    3、优化:增加对ggcor相关性组合图物种矩阵文件分组数量的检测,不能少于两组;

    4、优化:修复ggcor相关性组合图分组为两组以上,但分组过少时运行出错的bug;

    5、优化:修改Circos物种关系图的示例文件名;

  • 2021.08.13

    微课云 1.3.6 更新日志

    1、新增:ggraph绘制网络图;

    2、新增:ggplot2进阶版物种组成图;

    3、优化:修复ggcor相关性组合图模块图像重绘选择参数时,会导致当自定义颜色减少时,无法重绘的bug;

  • 2021.08.06

    微课云 1.3.5 更新日志

    1、新增:ggcor相关性组合图;

    2、优化:Qiime格式分类学信息输入文件Taxon Table兼容性优化,修复文件不能上传的问题;

  • 2021.07.30

    微课云 1.3.4 更新日志

    1、新增:TCseq基因表达趋势分析;

    2、新增:首页增加常用工具,展示使用次数最多的至多十个工具;

    3、优化:metacoder工具OTU丰度表检测逻辑完善修复,taxonomy列支持Unclassified;

    4、优化:增加对ggplot2-配对数据差异比较工具上传文件格式检测(OTU文件分组应恰好为2组、OTU分组两组数据量应一致);

  • 2021.07.22

    微课云 1.3.3 更新日志

    1、新增:ggplot2-配对数据差异比较;

    2、优化:Qiime格式分类学信息输入文件Taxon Table兼容性优化;

  • 2021.07.15

    微课云 1.3.2 更新日志

    1、新增:Metacoder 分类学树绘制;

    2、修复:修复edgeR差异分析模块中的火山图和火山图模块中绘图导致F阈值显示不正确的情况;

    3、优化:现在热图(Heatmap)模块的分组文件的分组名不能包含“-”符号了;

    4、优化:将edgeR差异分析模块的上传文件提示名修改为“上传基因数据表”;

    5、优化:将lefse分析2.0的类间因子Kruskal-Wallis秩检验的Alpha值、子类间配对Wilcoxon秩检验的Alpha值两个参数的默认值修改为0.05;

  • 2021.07.02

    微课云 1.3.1 更新日志

    1、更新:给pcoa、多样性指数盒形图、曼哈顿、circos、提琴、频率直方图、三维pca添加教程视频;

    2、更新:首页新增显示最近更新日志;

    3、修复:修复气泡图示例文件go和kegg相同的bug;

    4、修复:多元统计输入的矩阵文件形式进行统一,每一行是feature,每一列是sample。 如tSNE模块,对输入矩阵格式进行了转置优化;

    5、修复:组间相关性分析视频链接错误;

    6、修复:修复示例文件无法预览问题;

    7、优化:修改示例文件按钮展示效果;

    8、优化:最新工具和热门工具的默认数量由6个调整到10个;

    9、优化:pls-da模块的3D图添加更多的重绘参数。

  • 2021.06.22

    微课云 1.3.0 更新日志

    1、修改:将所有模块的分组文件(group)统一表头命名,统一左列为Sample、右列为Group(不区分大小写);

    2、优化:给所有的示例文件按钮添加预览和下载按钮

    3、优化:修复结果展示页面可能出现参数乱码的情况

    4、优化:修复PCoA模块结果文件内容不能下载的情况

  • 2021.06.10

    微课云 1.2.9 更新日志

    1、新增:截取序列工具;

    2、修改:将原(O)PLS-DA工具名修改为PLS-DA;

    3、新增:在PLS-DA工具中新增PLS-DA的3D图;

    4、修改:修改PCoA、PCA、三维PCA模块结果文件及结果图名称;

    5、修改:修改Tax4fun模块中间处理结果文件名

    6、修改:删除多样性指数盒型图中的se.chao1、se.ACE两个结果集展示结果图及数据;

    7、修改:将S.obs 表头名修改为Richness,将结果文件添加到结果列表中;

    8、优化:在原任务和图标上增加预览提示文字,增加用户体验;

    9、优化:在模块更新时间之前运行的任务,将不能看到运行结果列表以及重绘任务

  • 2021.04.15

    微课云 1.2.8 更新日志

    1、新增:edgeR差异分析;

    2、新增:tSNE;

    3、新增:picrust模块,用户同一时间运行模块任务数量限制为1个;

    4、新增:为节约空间资源,仅提供tiff图片的压缩包下载;

    5、新增:每个模块增加常见FAQ板块。GO、KEGG、PCA、热图、CCA、Lefse模块FAQ更新;

    6、新增:所有模块结构优化;

  • 2021.03.26

    微课云 1.2.7 更新日志

    1、新增:多样性指数盒型图

    2、新增:管理员版面,获取任务文件功能;

    3、新增:定期数据备份;

    4、优化:火山图优化,点颜色设置方式改变,新增参数:图例字体、图里标题、主标题相关参数;

    5、优化:组内相关性分析,组件相关性分析优化,对相关性分析后产生的NA数据进行处理,解决因为NA数据导致运行失败的问题;

    6、优化:组内相关性分析,组件相关性分析的网络图进行优化,添加参数:数据起始行,解决网络图绘制数据过大导致的页面卡死问题;

    7、优化:对输入文件格式进行统一优化处理,减少因文件内容格式问题导致的运行失败问题;

    8、优化:柱状图、revseq、getorf、lefse2模块,教学视频更新;

  • 2021.03.12

    微课云 1.2.6 更新日志

    1、新增:高级散点图;

    2、优化:柱状图,新增参数:X轴标题旋转角度、Y轴标题旋转角度

    3、优化:对所有模块上传矩阵文件进行处理,解决矩阵尾部存在空白数据导致运行失败的问题

  • 2021.03.05

    微课云 1.2.5 更新日志

    1、新增:RandomForest随机森林分析;

    2、优化:Picrust,添加选填参数:max_nsti、min_reads、min_samples、m、min_align、skip_norm。对seq.fasta输入文件OTU名称进行处理;

    3、修复:Circos图,修复输入文件中数值较小导致画图失败的问题;

    4、修复:修复饼图比例计算错误,导致绘图与数据不匹配的问题;

  • 2021.02.26

    微课云 1.2.4 更新日志

    1、新增:线性回归图;

    2、新增:多元线性回归分析;

    3、新增:站内信功能,另外添加来信提示标志,和反馈提示标志;

    4、优化:气泡图,新增参数:用于做图的行数;

    5、优化:断轴柱状图,新增参数:x轴字体水平偏移、x轴字体垂直偏移。用以解决X轴字体旋转后跟刻度线产生的对齐问题;

    6、优化:PCA、PCoA、NMDS、CCA、箱线图、断轴柱状图、曼哈顿图、误差折线图、树图treemap、柱状图、气泡图等模块,主标题位置调整为居中;

    7、优化:PCA,修复PCA分组文件SampleID与OTU文件SampleID顺序不一致,导致的绘图分组错误;

    8、修复:模块收藏按钮显示问题;

  • 2021.02.07

    微课云 1.2.3 更新日志

    1、新增:(O)PLS-DA;

    2、优化:频率直方图,主标题居中显示;

    3、优化:CCA/RDA环境因子线添加箭头;

    4、优化:气泡图,增加GO、KEGG文件格式兼容,新增参数:文件类型、Y轴描述绘制最大长度;

    5、优化:PCA,新增参数:是否归一化;

    6、优化:PCoA,新增参数:计算距离方法;

    7、优化:Lefse分析、TAX4FUN功能预测、Faprotax功能预测、Picrust2功能预测、Emboss Abiview、火山图模块,教学视频更新;

    8、优化:用户反馈,增加任务编号栏;

    9、优化:图片重绘界面优化,解决双勾问题;

    10、修复:火山图,分界线颜色设置不支持keyword颜色参数的问题;

  • 2021.01.29

    微课云 1.2.2 更新日志

    1、修复:权重网络图、组内相关性分析、组间相关性分析,结果文件存在NA数据时,任务状态一直是运行中的问题

    2、优化:频率直方图,xy坐标轴绘制;

    3、优化:断轴柱状图,参数断轴位置,更改为断轴区间,增加断轴上下限;

    4、优化:误差折线图,新增参数:误差线宽度;

    5、优化:wilcoxon秩和检验、分组文件格式统一,必须含有表头;

    6、优化:T检验,分组文件格式统一,必须含有表头。参数是否将两个方差作为相等的,更改为进行何种方差检验;

  • 2021.01.22

    微课云 1.2.1 更新日志

    1、新增:三维pca;

    2、优化:NMDS分析,新增参数:计算距离方法;

    3、优化:柱状图,新增参数:x轴字体角度;

    4、优化:GO富集分析和KEGG富集分析模块,随机读取并绘制数据,修改为从上至下读取并绘制数据;

    5、优化:primer3,删除参数:是否选择PCR引物、选择参数;

    6、修复:360浏览器下载文件后会重定向问题修复;

    7、修复:隐藏控件检查问题修复;

  • 2021.01.08

    微课云 1.2.1 更新日志

    1、新增:NMDS分析;

    2、修复:饼图重绘颜色设置不匹配的问题;

  • 2020

  • 2020.12.31

    微课云 1.2.0 更新日志

    1、新增:wilcoxon秩和检验;

    2、优化:Tax4Fun,新增参数:选择SILVA数据库、预计算方法。修复运行失败不报错,显示运行成功的问题;

    3、优化:权重网络图、组内相关性分析,组间相关性分析中的网络图,增加当前网络图节点、边详细信息下载功能;

    4、优化:lefse2.0,新增参数:最高分类学层级;

    5、优化:箱线图,新增参数:是否翻转横纵坐标轴;

    6、优化:柱状图,增加参数:Y轴标题, 柱子宽度,X轴样本排序自定义;

    7、修复:Faprotax,修复运行失败不报错,显示运行成功的问题;

    8、修复:热图,显示行列名选项反了的问题;

    9、修复:PCoA、PCA绘图失败问题;

  • 2020.12.18

    微课云 1.1.9 更新日志

    1、新增:Kruskal-Wallis秩和检验;

    2、新增:方差分析(ANOVA);

    3、新增:管理员页面,增加模块使用频率统计功能;

    4、新增:模块分类"菌群功能分析"

    5、修复:PCoA模块,分组问题修复;

    6、优化:添加lock,防止多次点击导致同一任务重复提交;

  • 2020.12.11

    微课云 1.1.8 更新日志

    1、新增:circos物种关系模块;

    2、新增:T检验;

    3、优化:进入旧版lefse模块跳出提示弹窗,是否跳转到lefse2.0页面;

    4、优化:lefse2.0,LDA判别分析结果将最后一级名称为norank other uncultured的数据筛除;

    5、优化:主页热门工具修改成显示使用频率最多工具;

    6、修复:火山图重绘,分界线颜色无法设置的问题;

    7、修复:重绘时间超过85s时,网络通信自动被关闭,前端接收不到任务完成状态,页面卡死在图片绘制中请耐心等待的状态中;

  • 2020.12.04

    微课云 1.1.7 更新日志

    1、优化:柱状图模块添加2参数:是否将低丰度结果合并为Other、合并丰度低于x%的OTU

    2、修复:收藏显示问题

    3、优化:三元图模块,输入文件变更为丰度表、三元分组文件、富集标注/物种关注文件。新增参数,点大小转换;

    4、优化:lefse2.0模块,多组分类分析的分析策略选项更改。差异特征图重绘,增加参数类名标签旋转角度;

    5、优化:lefse2.0、circos图、气泡图、树图和组间相关性分析模块,使用说明更新;

  • 2020.11.20

    微课云 1.1.6 更新日志

    1、新增:lefse2.0模块,增加LDA判别分析结果文件(仅含差异显著)。增加差异特征图,以及所有结果图的重绘功能;

    2、优化:柱状图模块重绘,增加参数图例信息排序;

    3、新增:组间相关性分析;

    4、优化:气泡图,去除气泡点大小设置,气泡点大小根据丰度值变化。添加背景色及网格;

    5、优化:误差折线图,添加横纵坐标轴;

    6、优化:断轴柱状图,添加横纵坐标轴;

  • 2020.11.6

    微课云 1.1.5 更新日志

    1、新增:树图(Treemap);

    2、新增:三原图;

    3、优化:热图,增加行分组和列分组的颜色设置;

    4、优化:Circos圈图,染色体间距参数优化,支持统一间隔设置和每个间隔单独设置;

    5、优化:GO,KEGG重绘的颜色设置方式更改,原有bug修复;

    6、修复:树状图取消分组画图失败的问题;

    7、修复:取消收藏功能存在取消失败的问题;

    8、修复:主页面导航栏背景色随页面上下滚动上移问题;

  • 2020.10.23

    微课云 1.1.4 更新日志

    1、新增:圈图;

    2、新增:表格转置;

    3、新增:两表格合并;

    4、新增:多表格合并;

    5、新增:主页增加滚动通知栏;

    6、新增:管理员版面增加滚动通知栏管理;

    7、优化:饼图、误差折线图、热图使用说明更新;

  • 2020.10.16

    微课云 1.1.3 更新日志

    1、新增:气泡图;

    2、新增:意见反馈版面:包括意见反馈和反馈记录;

    3、新增:管理员版面新增意见反馈部分;

    4、新增:任务运行日志查看;

    5、修复:PCA,PCoA,样本名显示问题修复;

    6、修复:频率直方图,示例文件数据存在问题导致绘图出错,已修复。模块界面增加频率参数;

    7、修复:lefse图示例文件导致的图片绘制失败问题,以及只能显示两组比较结果的问题;

    8、修复:网站更新时,正在运行中的任务失效,运行状态停留在运行中不显示失败的问题;

    9、优化:PCoA、断轴柱状图和频率直方图,3个功能模块的使用说明更新;

  • 2020.10.10

    微课云 1.1.2 更新日志

    1、新增:饼图;

    2、新增:误差折线图;

    3、新增:登陆信息加密传输;

    4、优化:Emboss Primer3 输入参数优化;

    5、优化:Emboss Primer3、Emboss Abiview、Emboss Getorf、Emboss Revseq、FAPROTAX功能预测,5个功能模块的使用说明更新;

  • 2020.9.25

    微课云 1.1.1 更新日志

    1、新增:PCoA;

    2、新增:断轴柱状图;

    3、新增:频率直方图;

    4、修复:维恩图每组显示数据数量多一个的问题;

    5、优化:柱状图将上传分组文件作为可选项;

    6、优化:Tax4Fun额外生成第二层级、第三层级丰度表的箱线图;

  • 2020.9.18

    微课云 1.1.0 更新日志

    1、新增:小提琴图;

    2、新增:树图;

    3、优化:Tax4Fun、PICRUST2、FAPROTAX功能预测的丰度表上传支持两种格式:txt格式和biom格式;

    4、优化:Lefse分析:只需上传输入一个OTU丰度表,丰度表支持两种格式:txt格式、biom格式;

    5、优化:火山图重绘增加2参数:X轴范围,Y轴范围;

    6、优化:曼哈顿图重绘增加参数:是否绘制分界线,分界线上下点的大小分别设置,X轴字体旋转角度,X轴字体相距X轴的距离,Y轴取值范围等;

    7、优化:结果文件列表增加内容预览;

    8、优化:更新组内相关性分析和柱状图的教学视频;

  • 2020.9.11

    微课云 1.0.9 更新日志

    1、新增:EMBOSS相关的功能模块,abiview、revseq、getorf、Eprimer3;

    2、新增:火山图;

    3、新增:曼哈顿图;

    4、优化:结果图重绘,字体大小参数改用滑动条设置;

    5、优化:添加了组内相关性分析和柱状图功能模块的使用说明;

    6、优化:部分使用说明和教学视频未更新的模块,贴上视频录制中敬请期待的提示;

  • 2020.8.28

    微课云 1.0.8 更新日志

    1、新增:新增PICRUST2功能预测;

    2、新增:新增lefse分析;

    3、优化:PCA重画新加参数,放大显示区域(x范围,y范围);

    4、优化:Tax4Fun,修复了Ko_table表头问题,结果添加箱线图、pca图;

    5、优化:组内相关性分析增加示例文件2;

    6、优化:公告发布富文本编辑器增加颜色和表情;

    7、优化:前端检查文件格式,异步导致无法及时获取正确检查结果的问题;

  • 2020.8.21

    微课云 1.0.7 更新日志

    1、新增:新增功能FAPROTAX功能预测;

    2、新增:软件搜索功能;

    3、新增:公告列表浏览。最新公告自动弹出机制:1.公告尚在有效期;2.用户未未读过该公告;

    4、新增:管理员面板:包括发布公告,修改用户权限;

    5、优化:将部分待开发的功能模块放上去了,点击后显示开发中提示;

    6、修复:修复文本框内回车键换行失效问题;

  • 2020.8.14

    微课云 1.0.6 更新日志

    1、新增:Tax4Fun功能预测,柱状图;

    2、新增:教学视频增加弹幕功能、播放调速、视频截屏等功能;

    3、修复:浏览器缓存问题导致的,图片重绘后下载的pdf,png,tiff,结果压缩文件包没有同步更新的问题;

    4、优化:添加维恩图、热图、权重网络图、kegg、go,五个功能的教学视频;

    5、优化:功能重绘参数部分重新布局,将改图参数分为三类:数据布局参数、颜色参数、字体参数。并增加提交重绘时,自动定位不合法参数所在位置;

  • 2020.8.5

    微课云 1.0.5 更新日志

    1、修复:修复组内相关性分析,只上传一个矩阵文件时,网络图连线重复问题,;

    2、更新:组内相关性分析网络图重绘,添加数据筛选板块,包括显示的小数点位数、p值检验阈值、c值检验阈值;

    3、更新:权重网络图重绘,添加数据筛选板块,具体包括同组内相关性分析;

    4、优化:更换组内相关性分析logo

  • 2020.8.4

    微课云 1.0.4 更新日志

    1、新增:组内相关性分析功能;

    2、新增:软件更新时间戳,实现软件更新后,在软件更新时间之前运行的任务只能下载结果文件,不能重新绘图;

    3、更新:所有软件使用说明更新;

    4、更新:箱线图,PCA,CCA的教学视频更新;

  • 2020.7.29

    微课云 1.0.3 更新日志

    1、新增:维恩图添加了文件格式的检查。upload lists type1:检查文件是否超过6列(作图最多6组);upload lists type2:检查table文件每行数据数量是否一致,检查内部数据是否为有效数字,检查第一行样品名是否重复存在;检查group文件行数是否超过6行(作图最多6组),检查每行中的样品名在table文件中是否存在;

    2、新增:维恩图使用说明、示例结果;

    3、新增:热图重新绘图增加参数,可调整横坐标文字旋转角度;

    4、新增:热图示例文件格式更新;

    5、优化:所有颜色选择器,支持手动输入色值;并增加色值有效性的检查;

    6、优化:我的任务中单个任务删除时,添加了是否确认删除的询问;

    7、优化:所有功能的示例文件,点击后文件内容将直接在新窗口显示,需要下载鼠标右键选择另存为;

    8、优化:注册账号时,点击密码和确认密码输入框跳出提示:安全起见,建议不要使用qq、微信、支付宝等常用密码;

    9、优化:输入错误网页地址报错问题,将重定向到404页面,提示页面丢失或不存在;

    10、修复:浏览器关闭,登陆状态失效问题;

    11、修复:点击我的任务,导航栏上下抖动问题;

  • 2020.7.21

    微课云 1.0.2 更新日志

    1、新增:维恩图添加了第二个文件上传接口,支持通过本身带有统计数据的矩阵文件和分组文件进行维恩图的绘制;

    2、新增:更新日志功能;

    3、新增:2个短信验证功能,修改个人信息、改绑手机号;

    4、变更:热图功能整体变更;

    5、修复:运行时间戳的时差问题;

    6、修复:热图结果图重绘xy轴字体设置相反问题;

    7、优化:我的任务界面优化;

    8、优化:个人中心界面布局优化;

    9、优化:任务详情,使用参数部分设计优化;

    10、优化:GO富集分析,盒型图(Boxplot),CCA/RDA,主成分分析(PCA)四个功能的使用说明更新;

  • 2020.6.30

    微课云 1.0.1 更新日志

    1、新增:GO富集分析,KEGG富集分析,主成分分析(PCA),CCA/RDA,热图(Heatmap),盒型图(Boxplot),权重网络图,维恩图,共8个软件功能;

    2、新增:3个短信验证功能,短信验证登录、短信验证注册、修改密码;

    3、新增:个人中心;

    4、新增:软件收藏功能;

    5、新增:我的任务,关键词搜索,任务批量删除等功能;